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始終堅(jiān)持“四個面向”為服務(wù)國家戰(zhàn)略需求貢獻(xiàn)科技力量,從先有臨床醫(yī)學(xué),再到預(yù)防醫(yī)學(xué)和康復(fù)醫(yī)學(xué)布局,組建了以五大研究院為核心的研發(fā)艦隊(duì),具備持續(xù)的技術(shù)創(chuàng)新能力和成果轉(zhuǎn)化能力。

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生物信息學(xué)

全組學(xué)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)

全組學(xué)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)支持多個測序平臺的多種組學(xué)數(shù)據(jù)的高效自動化分析。DNA層面包括全外顯子測序數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)和10x Genomics全基因組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。表觀組層面包括甲基化芯片數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)和免疫共沉淀測序數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。RNA層面包括轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)和RASL數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。此外,還包括微生物組擴(kuò)增子測序數(shù)據(jù)分析平臺和免疫組庫數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)等其它組學(xué)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。全組學(xué)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)為各組學(xué)技術(shù)搭建了平臺,同時為多組學(xué)聯(lián)合分析提供了基礎(chǔ)。通過對生物學(xué)樣本的組學(xué)數(shù)據(jù)提取和分析,可以從DNA、RNA、代謝組等多個層面挖掘和探究組學(xué)數(shù)據(jù),為解決生物學(xué)問題提供思路。組學(xué)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)從操作上能夠使各組學(xué)數(shù)據(jù)分析流程實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化和自動化,并通過設(shè)置常規(guī)分析和模塊分析滿足多樣化分析需求。同時,系統(tǒng)設(shè)有項(xiàng)目管理和任務(wù)管理模塊,實(shí)現(xiàn)用戶對項(xiàng)目和任務(wù)的全面實(shí)時監(jiān)控和跟進(jìn),更方便高效地進(jìn)行組學(xué)數(shù)據(jù)研究。



基于宏基因組學(xué)的臨床病原體鑒定

MAPMI®數(shù)據(jù)分析與管理云平臺包括數(shù)據(jù)分析管理系統(tǒng)和報(bào)告解讀系統(tǒng)。數(shù)據(jù)分析管理系統(tǒng)通過自建高質(zhì)量全類型的病原參考數(shù)據(jù)庫,實(shí)現(xiàn)對16,109種病毒、13,362種細(xì)菌、1,659種真菌、270種寄生蟲和2,500種耐藥基因的準(zhǔn)確檢測分析,并通過云計(jì)算技術(shù)實(shí)現(xiàn)了30分鐘內(nèi)完成一個run(約80GB)測序數(shù)據(jù)的快速并行分析。MAPMI®數(shù)據(jù)分析算法在多種類型臨床樣本中均具備良好的靈敏度和特異性,尤其適用于急危重癥和疑難感染樣本的分析與輔助診斷。報(bào)告解讀系統(tǒng)通過對數(shù)據(jù)分析結(jié)果的整合統(tǒng)計(jì)分析,實(shí)現(xiàn)了樣本信息管理、交叉污染判定、陽性病原體指標(biāo)篩選和審核、臨床檢測報(bào)告生成等功能。



藥物基因組

藥物基因組學(xué)以功能基因組學(xué)和分子藥理學(xué)為基礎(chǔ),結(jié)合藥代動力學(xué)和藥效動力學(xué),分析遺傳變異對藥物反應(yīng)的影響,有助于指導(dǎo)臨床醫(yī)生根據(jù)患者個體遺傳特征選擇適當(dāng)?shù)乃幬飫┬秃陀盟巹┝浚@得最優(yōu)化的臨床用藥指導(dǎo)。藥物基因組學(xué)數(shù)據(jù)平臺主要解決了基于患者個體遺傳信息,進(jìn)行精準(zhǔn)用藥解讀,從而輔助醫(yī)生選擇最優(yōu)的治療方式。目前,藥物基因組學(xué)數(shù)據(jù)平臺包含兩個主要的應(yīng)用方向,腫瘤藥物治療決策支持系統(tǒng)和精神類疾病精準(zhǔn)用藥解讀系統(tǒng)。


腫瘤藥物治療決策支持系統(tǒng)(OncoPDSS)由數(shù)據(jù)平臺、分析平臺和應(yīng)用平臺組成。數(shù)據(jù)平臺收集整理了腫瘤用藥指導(dǎo)信息,包括藥物說明書、NCCN等權(quán)威臨床指南。分析平臺能夠?qū)驒z測數(shù)據(jù)進(jìn)行在線分析與注釋。應(yīng)用平臺通過調(diào)用數(shù)據(jù)平臺的知識數(shù)據(jù),對分析平臺的基因檢測數(shù)據(jù)進(jìn)行精準(zhǔn)用藥解讀,生成腫瘤精準(zhǔn)用藥解讀報(bào)告,從而輔助臨床醫(yī)師對腫瘤患者進(jìn)行精準(zhǔn)治療。


精神類疾病精準(zhǔn)用藥解讀系統(tǒng)(MDPMS)基于藥物知識庫,結(jié)合患者基本信息和基因變異數(shù)據(jù),生成精神類疾病精準(zhǔn)用藥解讀報(bào)告,提供個性化的用藥指導(dǎo)。其中藥物知識庫收集整理了多類用藥證據(jù),包括藥物基因組學(xué)證據(jù)、藥物說明書,以及臨床試驗(yàn)信息。精神類疾病用藥解讀系統(tǒng)綜合多類證據(jù),確定可用、禁用、慎用的藥物列表,并提供臨床試驗(yàn)信息、基因-藥物關(guān)聯(lián)信息等,便于臨床醫(yī)生綜合判定后選擇最優(yōu)化的治療方式。


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